Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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GTF3C1Q12789 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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GTF3C1Q12789 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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GTF3C1Q12789 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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GTF3C1Q12789 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C1Q12789 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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