Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRDP23468 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms