Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms