Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LRRTM2O43300 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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