Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms