Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms