Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP4Q9P0V3 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SH3BP4Q9P0V3 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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SH3BP4Q9P0V3 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SH3BP4Q9P0V3 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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