Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GDE1Q9NZC3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms