Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LHX9Q9NQ69 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms