Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CIPCQ9C0C6 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CIPCQ9C0C6 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms