Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EDEM3Q9BZQ6 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.59□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EDEM3Q9BZQ6 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms