Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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