Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms