Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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