Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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