Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms