Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms