Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZIC1Q15915 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms