Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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SCN9AQ15858 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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