Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SS18Q15532 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SS18Q15532 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SS18Q15532 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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