Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PCOLCEQ15113 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms