Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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