Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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