Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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