Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DDX39BQ13838 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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