Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SHROOM2Q13796 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHROOM2Q13796 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms