Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PRPF4BQ13523 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PRPF4BQ13523 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRPF4BQ13523 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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