Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BFSP2Q13515 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms