Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
XRCC4Q13426 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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