Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SP140Q13342 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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SP140Q13342 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SP140Q13342 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SP140Q13342 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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