Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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RPA4Q13156 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RPA4Q13156 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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