Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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CSTF3Q12996 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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CSTF3Q12996 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CSTF3Q12996 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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