Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms