Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPEQ02224 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms