Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP53609 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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