Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LINC00587B1AMM8 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms