Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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