Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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SAMD8Q96LT4 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SAMD8Q96LT4 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SAMD8Q96LT4 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SAMD8Q96LT4 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SAMD8Q96LT4 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SAMD8Q96LT4 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SAMD8Q96LT4 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SAMD8Q96LT4 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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SAMD8Q96LT4 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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SAMD8Q96LT4 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SAMD8Q96LT4 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SAMD8Q96LT4 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SAMD8Q96LT4 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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