Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BCANQ96GW7 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BCANQ96GW7 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BCANQ96GW7 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms