Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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USP43Q70EL4 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP43Q70EL4 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP43Q70EL4 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP43Q70EL4 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP43Q70EL4 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP43Q70EL4 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP43Q70EL4 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP43Q70EL4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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