Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM43BQ6ZT52 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FAM43BQ6ZT52 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms