Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
C9orf135Q5VTT2 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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