Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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