Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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GEN1Q17RS7 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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GEN1Q17RS7 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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GEN1Q17RS7 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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GEN1Q17RS7 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GEN1Q17RS7 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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