Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CDO1Q16878 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CDO1Q16878 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CDO1Q16878 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDO1Q16878 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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