Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZFHX3Q15911 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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