Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN9AQ15858 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN9AQ15858 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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