Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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NEDD8Q15843 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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NEDD8Q15843 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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NEDD8Q15843 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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NEDD8Q15843 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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NEDD8Q15843 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD8Q15843 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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