Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NPTX1Q15818 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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