Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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HERC1Q15751 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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HERC1Q15751 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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HERC1Q15751 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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HERC1Q15751 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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HERC1Q15751 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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HERC1Q15751 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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